面对COVID-19的全球大流行，朱建伟教授团队应用单B细胞筛选抗体技术建立快速筛选全人的抗SARS-CoV-2病毒的中和抗体程序，纳入了18例康复期患者，从经免疫的组织或外周血中分离抗原特异性B细胞，然后通过免疫磁珠分选及流式细胞术多色分选技术得到了RBD阳性的记忆B细胞，获得549个可配对的IgG抗体，并结合高通量测序方案和高通量抗体表达技术平台，获得了一系列兼具活性和广谱能力的SARS-CoV-2中和抗体。随后在西湖大学等完成了冷冻电镜的抗体和病毒的作用解析，并对筛选获得的中和抗体2G1（抗alpha、beta、gamma、delta）和8G3(抗omicron)完成抗体评价（包括与抗原结合能力、理化性质、一般毒性、动物PK、动物体外体内抗病毒EC50）、通过产学研合作完成了中试规模的GMP生产及质量控制，完成申报临床试验所要求的系统性药学研究、药理药效学、非临床药代和安全性评价研究，2个中和抗体均申报获得了国家药品监督管理局药审中心（CDE）批准的临床试验批件（2022LP00066、2023LP01202）。

在疫情爆发初期，中心张振锋研究员团队迅速组织参与了抗病毒药物瑞德西韦的联合攻关，基于催化剂分子骨架的角度调控策略，创制了结构独特的中心手性、轴手性和面手性等三类催化剂，并将其应用于多例高效不对称催化反应，实现了抗病毒药物瑞德西韦等手性药物的高效不对称催化合成。相关成果发表在化学类国际顶级期刊Angew. Chem. Int. Ed.（2020, 59, 20814-20819）上并申请授权中国发明专利（ZL 202010495819.5），获得2020年度上海市科学技术奖一等奖（图3-36）。并在上述技术基础上开展产业化转化工作，入选第二届上海交通大学“十大科技进展”。